대학본부는 1988년 5월 18일에 착공되어 1989년 5월 24일 건립된 건물로, 총장을 비롯한 여러 교수들과 직원들이 근무하고 있는 곳입니다. 총장실, 부총장실, 총무과, 재무과, 교수지원과 등 학내 주요 부서가 모여 있어 사람들의 출입이 잦으며, 농협 출장소가 1층에서 영업하고 있기 때문에 지역 주민들의 방문도 잦은 편입니다.
현재 대학본부 앞에 크게 건립되어 있는 교육박물관은 본래 대학본부 5층에 있던 작은 사무실이었습니다. 현재 5층에는 교수지원과를 비롯한 행정부서가 자리를 잡고 있습니다. 개교 당시에 각종 행정부서는 모두 교양학관에 있었으나, 대학본부가 세워지고 나서 이곳으로 모두 이전하였습니다. 대학본부 앞 광장에서는 학교에 문제가 생길 때마다 학생들이 모여 집회를 열고 학교의 현안에 대해 의견을 나누고 표현하곤 했습니다. 1990년 겨울 임용시험 반대 투쟁과 1999년 학내 구조조정 반대 투쟁, 2005년 초봄의 기성회비 인상 반대 투쟁이 그 대표적인 예입니다.